医院中央空调的运行目的是为病人及医护人员提供一个良好的工作治疗环境。为了提高医护质量、病菌传染率，需要对室内的温度、湿度、清洁度进行控制。
　　4.1 对空气流通性进行管理
　　空气的流动性对于室内空气的品质有着重要的作用。保障室外新风的新鲜度，合理的采集新风系统同时对新风采取过滤、处理，从而为室内空气的清洁性提供一个良好的环境。
　　4.2 对病房温度进行调节
　　病房的温度不仅影响到病人的康复情况，而且还对医务人员的工作情绪产生重要的影响。医院病房人流量大，每个人对于温度的要求都有不同，这就需要空调的管理人员与病人及医疗工作者进行沟通，对于陪床人员做好工作，加强管理，从而保持病房所需的温度。
　　4.3 保证空调的洁净度
　　医院对于室内空气的洁净度要求很高，对于空调的净化系统也应该给予高度的重视，对于空调应该进行定期检查，对于过滤器进行清洗。一般情况下， 粗效过滤器每星期清洗一次，中效过滤器则应该每一个月清洗一次，每半年更换一次，高效过滤器则应该一年更换一次，或视实际情况调整清洗和更换频率。另外， 对于新风、排风机组都应该进行定期的清洗。
　　4.4 预防细菌的滋生
　　对空调器的所有部件进行清洗，一般采用紫外线灯或者臭氧机进行消毒。还应该密切注意空调的运行情况，一旦出现损坏，应该进行及时的维修。还应该与感染控制部门进行密切的合作，实时监控空气的质量，防止感染事件的发生。